ساختار پیمانکاری نوع بسیار پیچیده و سنگین یک ساختار خدماتی است. یک شرکت پیمانکاری فروشنده خدمات به کارفرمای خود و دریافت کننده خدمات از پیمانکار زیر دست می‌باشد. تعدد پروژه‌ها، نقش‌های توأم کارفرما / پیمانکار، گردش نیروی انسانی و دارایی‌های فیزیکی بین پروژه‌ها، مدیریت جریان نقدینگی بین پروژه‌ها و پیمانکاران، مدیریت جریان کالا در پروژه‌ها و سایر مشکلات از این دست موجب پیچیدگی‌های بسزای ساختارهای پیمانکاری می‌شوند.
موضوع اصلی در یک ساختار پیمانکاری، پروژه و اجزای پروژه است. بهای تمام شده پروژه‌ها در مقیاس مراکز هزینه پروژه محاسبه می‌شود و مبنای دریافت و پرداخت اقلام قابل تحویل است که این اقلام از WBS پروژه استخراج می‌شوند. از سوی دیگر مدیریت ارتباط سه جانبه «پروژه – پیمانکار – منابع انسانی و فیزیکی» در هر پروژه اهمیت بسزایی دارد که اگر با دقت انجام نشود جریان نقدینگی سازمان و پروژه‌ها دچار بحران می‌گردد.
یکی دیگر از مشکلات ساختارهای پیمانکاری، وجود ستاد مشترک در سازمان است. ستادی که معمولاً متشکل از دفاتر مهندسی، نظارت، ایمنی، مالی، مدیریت سازمان و غیره می‌باشد. تعیین محل ثبت هزینه‌های ستاد و نقش آن در بهای تمام شده پروژه، یکی دیگر از مسائل دائمی این قبیل ساختارها است.
سیستم مالی یکپارچه نوسا با استفاده از ساختار یکپارچه تحت وب مبتنی بر بستر SOAP به سازمان‌هایی که پروژه‌های پراکنده دارند کمک می‌کند با یک سیستم متمرکز نرم‌افزاری و سخت‌افزاری گردش مالی و عملیاتی تمام پروژه‌ها را همزمان مدیریت نموده و گزارشات آنلاین از کل سازمان به مدیریت ارائه نمایند.